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RealPure动物组织/细胞RNA提取试剂盒
RealPure动物组织/细胞RNA提取试剂盒
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RealPure Animal Tissues/Cell RNA Extraction Kit RealPure动物组织/细胞RNA提取试剂盒
试剂盒内容及保存: 试剂盒组成 RTR2306-01 (50次) 贮存方式 裂解液RL 30 ml 常温 去蛋白液RD 30 ml 常温 漂洗液RW(浓缩液) 25 ml 首次使用按照标签加入无水乙醇 常温 RNase-free水 5 ml 4℃ DNA清除柱CS(RNase-free) 50个 常温 RNA吸附柱CR(RNase-free) 50个 常温 收集管 100个 常温 2 ml离心管(RNase-free) 50个 常温 1.5 ml离心管(RNase-free) 150个 常温 说明书 1份  
储存条件和效期: RNase-free水4℃贮存;其他试剂在常温(25℃左右)干燥条件下,可保存1年。试剂盒常温运输。

产品简介:: 本试剂盒可从动物组织中快速提取总RNA,可同时处理大量不同样品。提取的总RNA纯度高,没有蛋白和其它杂质的污染,可用于RT-PCR、RealTime RT-PCR、芯片分析、Northern Blot、DotBlot、PolyA 筛选、体外翻译、RNase保护分析和分子克隆等多种下游实验。
准备工作: 1操作前在裂解液RL中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1ml RL中加入10 μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RL4 ℃可放置3天。 2按照标签所示在漂洗液RW中加入无水乙醇(自备),混匀后盖紧瓶盖后常温贮存备用。 3所有离心步骤均在常温下进行。
操作步骤: 1. 样品处理和裂解: 1.1 贴壁细胞: 1.1.1直接裂解法: 不需胰酶消化,彻底吸干净培养液体后直接加推荐量裂解液 RL(使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇)(下表)反复吹打细胞裂解,可以漩涡震荡,直到看不到细胞团为止,进行步骤2。 培养器皿 底面积(cm2) 加培养液量 ml 可获细胞量 裂解液RL加入体积 24孔培养板 2 1 5×106 350 μl 3.5cm培养皿 8 3 2×106 350 μl 6孔培养板 9.6 2.5 2.5×106 600 μl 6cm培养皿 21 5 5.2×106 600 μl 25cm培养皿 25 5 5.2×106 600 μl 100ml玻璃培养瓶 33 10 7×106 600 μl 1.1. 2 胰蛋白酶消化法: 确定细胞数量(收集细胞数量请不要超过1×107),吸除培养基,用PBS洗涤细胞,吸除PBS,向细胞中加入胰酶消化液处理细胞,当细胞脱离容器壁时,加入含有血清的培养基失活胰蛋白酶,将细胞溶液转移至1.5 ml离心管中,300×g离心5min,收集细胞沉淀,仔细吸除所有上清,加 350 μl(<5x106细胞)或 600 μl(5x106-1x107细胞)裂解液 RL(使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇),反复吹打细胞裂解,可以漩涡震荡,直到看不到细胞团为止,进行步骤2。 1.2 悬浮细胞: 300×g离心 5 min收集悬浮细胞(收集细胞数量请不要超过1×107)到一个1.5ml 离心管中,完全吸弃上清,加 350 μl(<5x106细胞)或 600 μl(5x106-1x107细胞)裂解液 RL(使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇),反复吹打细胞裂解,可以漩涡震荡,直到看不到细胞团为止,进行步骤2。    1.3 动物组织:        新鲜组织加入350μl(<20mg 组织)或者600 μl(20-30mg 组织)的裂解液RL(使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇)后玻璃匀浆器或电动匀浆器将组织彻底研磨匀浆,进行步骤2。 注意:组织量一定不要超过30 mg,否则将导致RNA得率和质量下降。 背景知识:样品处理量绝对不要超过DNA/RNA吸附柱处理能力,否则造成DNA/RNA残留或者产量降低。不同组织细胞种类DNA/RNA相差极大,例如胸腺脾脏DNA含量丰富,超过5 mg就会超过柱子处理能力。COS细胞RNA含量丰富,超过3x106细胞就会超过柱子吸附能力。所以开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量时宁可使用较少的样品处理量,如细胞不超过3-4x106,组织不超过10mg,随后根据实验结果增加或者减少处理量。 2. 离心得到上清: 若没有不溶性沉淀,直接进行步骤3。如有不能裂解的碎片或者不溶物,13,000rpm离心5 min, 取裂解物上清进行下一步。 3. 去除基因组污染和洗脱RNA: 将DNA清除柱CS放入一干净的2 ml离心管内,用移液器小心将步骤1离心管内的溶液或步骤2离心后的上清全部转移到DNA清除柱CS中,13,000rpm离心2分钟(RNA在离心管滤液中,不要丢弃)。 注:确保全部溶液都收集到2 ml离心管中,如果膜上有残留液体,延长离心时间至5分钟,保证膜上无残留液体。 4. RNA挂柱:   向2 ml离心管滤液中加入0.5倍体积的无水乙醇(如滤液体积为300 μl/600 μl,加入150μl/300 μl无水乙醇),此时可能会出现沉淀,立即混匀,不要离心。将全部溶液加入到RNA吸附柱CR中(吸附柱放入收集管中),13,000 rpm离心1分钟。 注:确保溶液全部过滤到收集管中,膜上无残留,如有必要,可以延长离心时间至5分钟。 5. 去除RNA中的蛋白污染: 向RNA吸附柱CR中(吸附柱放入收集管中)加入500 μl 去蛋白液RD,13,000rpm离心1分钟,弃废液。 6. 去除RNA中的其他杂质: 向RNA吸附柱CR中加入700μl漂洗液RW(使用前请先检查是否已加入乙醇), 13,000 rpm离心1分钟,弃废液。 7. 进一步去除RNA中的其他杂质: 向吸附柱CR中加入500μl漂洗液RW (使用前请先检查是否已加入乙醇),13,000 rpm离心1 分钟,弃废液。 8.  关键步骤:彻底去除吸附柱上的残余乙醇: 将吸附柱CR放回收集管中,确保盖好吸附柱管盖,13,000 rpm将吸附柱CR空甩离心2 分钟,去除吸附柱上的残余液体。 注:此步骤目的是将吸附柱中残余漂洗液去除,如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验操作。 9. 洗脱得到RNA: 将RNA吸附柱CR转入一个新的1.5 ml RNase-free离心管中,向吸附柱O型垫圈中央悬空加入50-100 μl RNase-free水(事先65℃预热可提高洗脱效率),盖好吸附柱管盖,常温放置2分钟,13,000rpm离心2 分钟。 注:确保水要加到膜的中央,不要贴壁加入;洗脱缓冲液体积不应少于50 μl,体积过小影响回收效率。 10.  RNA贮存: RNA样品-80℃中保存。
RNA产量和质量的评估: 1. RNA产量: 用分光光度计测定OD260的吸光值来计算RNA产量。将RNA按照一定的比例稀释于TE溶液(10mMTris pH8.0,1mMEDTA)中,根据以下公式计算: A260×稀释倍数×40=μgRNA/ml 注:测定OD值时,尽量不要用RNase-free水稀释RNA,因为RNase-free水pH较低,测定的OD值偏低。 2. RNA质量: 凝胶电泳检测:凝胶电泳中,动物的完整RNA应该有两条主带:28S和18S,并且28S亮度应该与18S相当或是其亮度的2倍。可以使用普通的1×TAE琼脂糖凝胶电泳,凝胶浓度1-1.5%,可以使用高电压,短时间电泳,如7V/cm电泳,20分钟。建 议使用D2000DNA ladder(Cat:RTM415)作为Marker。28SrRNA迁移率与1800bp类似,18SrRNA迁移率与700bp类似。 吸光值检测:可以用A230,A260和A280的数值表示RNA的纯度。纯净的RNA的A260/A280比值应该为2,我们得到的RNA样品比值应在1.8-2.2之间,如果比值低于1.8,表明RNA样品中蛋白污染比较严重。A260/A230比值应该在2-2.2之间。如果此比值低于2,表明RNA样品中有胍盐的污染。  
实验示例:                             1.2%琼脂糖胶   1×TAE 150V 25minRealSafe Red预染 RNA提取试剂提取步骤:K562悬浮细胞,1 ml收集(6×106/ml),PBS漂洗两遍,加入1 ml RNA提取试剂,悬浮后常温静置10分钟,加入氯仿或氯仿替代物200 μl,彻底混匀后静置10分钟,自然分相,4度 13000 rpm 离心15分钟,上清中加入等体积异丙醇,常温静置20分钟,4度 13000 rpm离心15分钟,沉淀用1 ml 75%乙醇漂洗,4度 8000rpm 离心2分钟,沉淀溶于50μlRNase-free水中。 RTR2306操作简述如下:K562悬浮细胞,1ml收集(6×106/ml),PBS漂洗两遍(平行做2管)。沉淀中加入350 μl 裂解液RL(已加β-ME),常温裂解5分钟,裂解物加到DNA清除柱CS中,离心收集到2 ml离心管中,离心管中加入0.5倍体积无水乙醇,全部溶液加到RNA吸附柱CR中,离心,随后清除柱CS和RNA吸附柱CR一次RD漂洗,2次RW漂洗,最后每个吸附柱用50 μlRNase-free水洗脱,合并两管得到100 μl RNA和100 μl去除的基因组DNA。
问题指南: 1. 离心柱发生堵塞 离心柱发生堵塞之后会造成 RNA 得率降低甚至不能纯化得到 RNA。 常见原因分析如下: 1.1组织或细胞破碎不彻底。 破碎不彻底会使吸附柱发生堵塞,同时会影响 RNA 得率及质量。我们建议在进行裂解时,尽量借助辅助手段如机械匀浆彻底破碎组织。 1.2 样本初始量过多。 样本使用量过多会导致裂解液RL裂解细胞时不完全,导致离心柱堵塞。该试剂盒处理样本的初 始最大量107细胞或30 mg组织。 1.3 离心机的温度过低。 整个 RNA 分离纯化所有的步骤均在常温(20-25℃)进行。有些低温离心机的温度低于 20℃,可能会造成离心柱的堵塞。如果发生这种现象,请将离心机温度设置到20-25℃。 2. 提取不到RNA或者RNA产量低 通常会有多种因素影响回收效率,比如:样本 RNA 含量、操作方法、洗脱体积等。 常见原因分析: 2.1  样本保存不当或样本保存时间过久导致RNA 已经降解。 建议:新采集的样本应立即放入液氮中速冻,长期保存于-70℃并避免样本的反复冻融;或者将样本立即浸泡在 RNA 稳定剂RNAwait溶液中。 2.2  样本破碎裂解不充分导致纯化柱堵塞。 建议:参见1。 2.3  洗脱液添加不正确。 建议:确认 RNase-Free 水滴加到了纯化柱膜O型垫圈中央位置。 2.4  漂洗液RW中没有添加正确体积的无水乙醇。 建议:请按照说明书,在试剂盒使用前,漂洗液RW中添加正确体积的无水乙醇并混匀。 2.5  组织样本用量不合适。 建议:每 600 μl 裂解液RL使用最大细胞量为1×107,使用最大组织量为30mg,过多会导致RNA 提取量降低并且得到的RNA 纯度也会降低。我们强烈建议每单次RNA提取操作,样本初始用量一定不要超过最大建议量。 2.6  洗脱体积不合适或洗脱不彻底。 建议:纯化柱的洗脱液体积为 50-100 μl;若洗脱效果并不理想,建议在加入65℃预热的RNase-Free 水后,延长常温放置的时间,例如放置5-10 min。 2.7  纯化柱在第二次RW洗涤之后有乙醇残留。 建议:漂洗液RW洗涤后,吸附柱空甩离心2 min是关键步骤,以充分除去吸附柱上残留的乙醇。 3. 纯化获得的RNA有降解 纯化得到的 RNA 的质量和样本的保存、RNase 污染、操作等因素有关。 常见原因分析: 3.1  组织样本采集后没有及时保存。 建议:组织样本在收集后若不及时使用,请立即低温保存于液氮中或经液氮速冻后立即转移至-70℃ 长期保存,或者将样本立即浸泡在 RNA 稳定剂 RNAwait溶液中。提取 RNA 请尽量使用新近采取的组织样本。 3.2  组织样本反复冻融。 建议:组织样本保存时,最好分装成小份,使用时取出其中一份即可,避免样本的反复冻融导致 RNA 的降解。 3.3  操作间有 RNase 引入或没有佩戴一次性手套、口罩等。 建议:RNA 提取实验最好在单独的 RNA 操作间进行,并在实验前清理好实验桌,实验时佩戴一次性手套、口罩,最大程度上避免RNase 引入导致的RNA降解。 3.4  试剂在使用过程中被 RNase 污染。 建议:更换新的提取试剂盒进行相关实验。 3.5  RNA 操作时所用的离心管、枪头等有 RNase 污染。 建议:确认 RNA 提取时所用到的离心管、枪头、移液器等都是 RNase-Free。 4. RNA中含有DNA污染 4.1 提取的起始材料量超过最大建议量 建议:步骤1-样品处理时使用107细胞或30mg组织,不要超过最大处理量,否则样品的核酸量会超过DNA清除柱CS的处理极限,导致洗脱下的RNA有基因组DNA的污染。 4.2  省略了步骤3-去除基因组污染步骤。 建议:步骤3-去除基因组污染步骤必不可少,不能省略。DNA清除柱CS能极大限度的去除上清液中的基因组DNA,使用裂解液RL洗脱下的RNA基本无基因组DNA的污染。 4.3  跳过了使用去蛋白液RD的漂洗步骤(见操作步骤第5步)。 建议:这一步骤对于除去残留的 DNA 以及杂质蛋白十分重要,一定不能省略,否则将会导致纯化得到的RNA 中含有DNA污染和蛋白污染。 5. 纯化获得的RNA影响下游实验 经吸附柱纯化的 RNA,如果盐离子、蛋白质含量过多会影响下游实验,比如:逆转录、NorthernBlot 等。 1.  洗脱后的 RNA 有盐离子残留。 建议:确认漂洗液RW中添加了正确体积的乙醇,并按操作说明的离心转速进行2次RW洗涤吸附柱 (见操作步骤第6,7步)。 2.  洗脱后的 RNA 有乙醇残留。 建议:确认 RW第二次洗涤后,按操作说明的对吸附柱进行空管离心操作(见操作步骤第8 步),如果还有乙醇残留,可以将空管离心后吸附柱开盖常温放置 5 min,以最大程度上去除
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