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2×GC缓冲液
2×GC缓冲液
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2×GC Buffer
     产品组成: 目录号 规格 价格 RTB3101-01 1ml 50元 RTB3101-02 5×1ml 200元 RTB3101-03 10×1ml 300元
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用途: PCR 扩增复杂结构的 DNA 片段。
产品说明和注意事项: 1. 本产品能与各种PCR酶配合使用,能够扩增具有复杂二级结构模板(GC rich、重复序列等)的PCR片段。 2. 使用 GC Buffer 进行 PCR 扩增时,建议使用 Tm 值较高的引物。因此,引物最好设计在 30 mer 左右。 3. 使用 GC Buffer扩增的 GC rich 的DNA 片段长度,会因 GC 含量不同而各有差异。 4. 由于 GC Buffer 和一般的PCR Buffer 相比 DNA 变性效果较强,因此,一般的 DNA片段(GC含量低于50%的目的片段)不推荐使用2×GC buffer进行扩增。
使用说明: 1.按照下表在0.2mlPCR管中制备反应体系:   成分 25μl反应体系 50μl反应体系 终浓度 Template 0.05-0.5 μg 0.1-1 μg as you wish Primer 1(10 μM) 0.5 μl 1 μl 200nM Primer 2(10 μM) 0.5 μl 1 μl 200nM 2×GC buffer 12.5 μl 25 μl 1× dNTP Mixture(10 mM) 0.5 μl 1 μl 200μM each Taq (5 U/μl) 0.25-0.5 μl 0.5-1 μl 2.5-5U ddH2O up to 25 μl up to 50 μl - 2. 混匀后,离心快甩将反应液收集到管底。 3. PCR仪如果没有热盖加热的话,补加25μl矿物油。 4. PCR仪上执行以下程序: 两步法: 步骤 温度 时间 循环数 初始变性 94℃ 5 min 1 变性 94℃ 30 sec 25-40* 退火和延伸 68℃ 1 min/kb 最后延伸 72℃ 5 min 1 *注: PCR 反应条件视模板、引物等的结构条件不同而各异。在实际操作中需根据模板、目的片段的大小、碱基序列和引物的长短等具体情况,设定最佳的反应条件(温度、时间等)。 1. 怎样确定扩增片段的GC含量大小?    推荐使用Oligo软件分析片段的GC含量(如下图所示)。   2.2×GCbuffer能扩增正常GC含量片段吗? 2×GCbuffer可以扩增GC含量正常的模板。然而,由于GCbuffer有比较强的变性效果,因此一般的模板使用GC buffer扩增时,有时会降低扩增效率。 3.2×GCbuffer能兼容大多数PCR用酶吗? 2×GCbuffer能兼容大多数PCR酶,比如Taq,Taqplus,Long Taq等,可以根据片段长度以及保真性要求选择不同的酶。 4. 使用GCbuffer扩增时,为什么推荐使用两步法? 由于目的片段GC含量高,引物的Tm值往往会比较高,在PCR时,当退火温度和延伸温度差距较小时,比如退火温度超过60℃时,退火温度和延伸温度可以设成同一数值,一般为68℃。 2×GC bufferlane 1-5: Rice 390bp fragement(GC% 77.1%)lane 6-10: Rice 760bp fragement(GC% 72.9%)lane 1 and 6: TaKaRa 2×GC buffer Ilane 2 and 7: TaKaRa 2×GC buffer IIlane 3 and 8: RTB3101 2×GC bufferlane 4 and 9: RTB3106 10×Taq PCR bufferlane 5: Rice 390bp,RTB3101 2×GC buffer, 三步法扩增lane 10: Rice 760bp,RTB3101 2×GC buffer, 三步法扩增
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