1）直接涂片：萋-尼（热染法）或Kinyoun（冷染法）抗酸染色，寻找耐酸细菌。
2）细菌收集涂片：主要方法是沉淀收集法和漂浮收集法。
3）荧光显微镜检查：金胺“O”染色，分枝杆菌可以在荧光显微镜下发荧光。
